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新发现有望为CRISPR带来基因编辑好帮手
日期:2020-11-23  来源:《中国科学报》  作者:

落在细菌上、正在感染细菌的噬菌体病毒,如今科学家发现了逆转录子的新功能,有望阻止噬菌体感染细菌。图片来源:《科学》

  2020年诺贝尔化学奖颁给了基因编辑工具CRISPR,如今,研究者又有新发现,有望与CRISPR结合,发挥更好的功用。

  11月初,来自以色列魏茨曼科学研究所的Rotem Sorek团队在《细胞》上刊发文章,介绍了他们新发现的基于逆转录酶基因编辑工具——Retrons。与CRISPR类似,该工具可保护微生物免受噬菌体病毒侵害,研究者有望利用它对单细胞生物的基因进行编辑。

  早在30多年前,就有科学家从黄色黏球菌中发现了逆转录酶,这一遗传元件由DNA、RNA和来自某些细菌中的蛋白质复合而成,但一直以来它们在生物体中的作用不甚明确。

  据《科学》报道,在最新发表的研究里,Sorek等人在许多细菌中都发现了逆转录酶。他们先搜索了近4万个细菌的基因组,并利用计算机程序寻找与CRISPR和其他已知抗病毒构建体基因相近的抗病毒结构。

  之后,研究者找到了一段包含逆转录酶的DNA,该元件侧翼是无法编码任何已知细菌蛋白的DNA片段。研究者联想到这些神秘的序列可能在RNA编码中发挥作用。此外,带逆转录性质的DNA通常伴随着一个蛋白质编码基因,每个遗传元件携带的蛋白质有所不同。

  Sorek等人猜测,这些序列簇参与到一种新的噬菌体防御中。后续研究中,他们进一步证明,包含了逆转录酶、DNA和RNA混合物以及蛋白质的元件Ec48可破坏新感染的细胞,从而使病毒无法复制和传播。

  无独有偶,欧洲分子生物学实验室也有一个研究团队有类似发现,他们在沙门氏菌中逆转录的编码基因旁边发现了有毒的蛋白质基因,通常情况下毒素会被包裹起来,当噬菌体蛋白出现时则被激活。相关研究已于今年6月刊发于预印本平台bioRxiv。

  研究者可利用CRISPR靶向并切割基因组中的目标区域,但迄今为止,该工具还不太擅长在靶点DNA中引入新代码,若CRISPR能与此次发现的Retrons相结合,或许能产生所需序列的多重拷贝,并有效剪接到宿主基因中。不过目前,Retrons还未被证实可在哺乳动物细胞中工作,还有许多工作有待完成。(袁柳)